Etter lanseringen av Final Cut Studio 2009, har mange ventet på første oppdatering for å få luket bort feil som for eksempel Compressor sine Frame Controls, som ikke har fungert skikkelig siden lansering av Compressor 3.5. Apple har nå gitt ut Pro Applications Update 2009-01, som inneholder Final Cut Pro 7.0.1, Compressor og Qmaster 3.5.1, Motion 4.0.1, Soundtrack Pro 3.0.1 og Color 1.5.1.
Apple har gitt ut Pro Applications Update 2008-02 og Final Cut Server 1.1. Det nye i Pro Applications-oppdateringen er Final Cut Pro 6.0.4. Denne versjonen skal rette opp feil "audio sample rate" i presets for XDCAM HD422, gi bedre støtte for innlasting av HDV med QuickTime 7.5, og sist men ikke minst gi støtte for siste versjon av Final Cut Server. For flere detaljer, se Apples release notes for Pro Applications Update 2008-02 og Final Cut Server 1.1.